Bettina Wegner wurde in Berlin (West) geboren. Nach der Gründung der DDR übersiedelten ihre Eltern – überzeugte Kommunisten – mit ihr nach Ostberlin. Sie erlernte den Beruf einer Bibliotheksfacharbeiterin und begann 1966 ein Studium an der Schauspielschule Berlin. 1966 war sie Mitbegründerin der Oktoberklubs, der jedoch zu diesem Zeitpunkt noch Hootenanny-Klub hieß.

Nachdem sie mit Flugblättern gegen die Intervention der Warschauer Paktstaaten in der Tschechoslowakei protestiert hatte, wurde sie exmatrikuliert, verhaftet und wegen „staatsfeindlicher Hetze“ auf Bewährung verurteilt. Nach „Bewährung in der Produktion“ besuchte sie die Abendschule, holte ihr Abitur nach und absolvierte 1971/72 eine Ausbildung als Sängerin am Zentralen Studio für Unterhaltungskunst. Seitdem lebt sie freischaffend.

Eigene Veranstaltungsreihen (Eintopp, Kramladen) gemeinsam mit Klaus Schlesinger, mit dem sie von 1970 bis 1982 verheiratet war, wurden von staatlichen Stellen verboten. Nach öffentlichem Protest gegen die Ausbürgerung Wolf Biermanns 1976 wurden ihre Auftrittsmöglichkeiten immer weiter beschnitten, sie wurde bespitzelt, unter Druck gesetzt und nach Einleitung eines Ermittlungsverfahrens „wegen Verdachts auf Zoll- und Devisenvergehen“ vor die Wahl gestellt: Gefängnis oder Ausbürgerung (1983). Daraufhin zog sie nach Westberlin um, arbeitete nun im Westen als linke, kritische Liedermacherin weiter. Ihr bekanntestes Lied ist Kinder („Sind so kleine Hände...“) aus dem Jahre 1979.

Sie trat u.a. gemeinsam mit Joan Baez, Konstantin Wecker, MTS (Band) und Angelo Branduardi auf. In den 90er Jahren gab sie regelmäßig erfolgreiche Konzerte und veröffentlichte mehrere CDs, verschwand aber aus den Medien wie TV und Hörfunk. Nach über 30 Jahren Tourneen und Plattenveröffentlichungen verabschiedete sich Bettina Wegner 2007 mit einer letzten Tour vom Beruf. Anlass dafür sind (nicht nur) gesundheitliche Gründe: „Es wird gefeilscht wie um eine alternde Hure. Natürlich habe ich meinen Preis (...) Es muss ein Ende haben, Sängerin ist dann nicht mehr mein Beruf, auch wenn ich weiter singe – Benefiz oder besondere Anlässe zu Beispiel (...)“ (aus der Berliner Zeitung vom 27. Januar 2007).